Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neurl1bQ0MW30 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms