Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn2bQ0KL01 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn2bQ0KL01 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn2bQ0KL01 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn2bQ0KL01 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn2bQ0KL01 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn2bQ0KL01 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ubxn2bQ0KL01 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ubxn2bQ0KL01 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms