Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Hoxc4Q08624 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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