Protein–RNA interactions for Protein: Q07968

F13b, Coagulation factor XIII B chain, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13bQ07968 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
F13bQ07968 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13bQ07968 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13bQ07968 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
F13bQ07968 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms