Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Cdx4Q07424 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms