Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Top1Q04750 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top1Q04750 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Top1Q04750 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top1Q04750 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top1Q04750 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Top1Q04750 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms