Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ddr1Q03146 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms