Protein–RNA interactions for Protein: Q03142

Fgfr4, Fibroblast growth factor receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr4Q03142 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Fgfr4Q03142 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fgfr4Q03142 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fgfr4Q03142 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fgfr4Q03142 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fgfr4Q03142 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fgfr4Q03142 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fgfr4Q03142 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fgfr4Q03142 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fgfr4Q03142 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fgfr4Q03142 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fgfr4Q03142 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fgfr4Q03142 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fgfr4Q03142 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fgfr4Q03142 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Fgfr4Q03142 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms