Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mmp11Q02853 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms