Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gjb5Q02739 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gjb5Q02739 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms