Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GscQ02591 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GscQ02591 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GscQ02591 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GscQ02591 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GscQ02591 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GscQ02591 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GscQ02591 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GscQ02591 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GscQ02591 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GscQ02591 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GscQ02591 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GscQ02591 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GscQ02591 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GscQ02591 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GscQ02591 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GscQ02591 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GscQ02591 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GscQ02591 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GscQ02591 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GscQ02591 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GscQ02591 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GscQ02591 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GscQ02591 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GscQ02591 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GscQ02591 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GscQ02591 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GscQ02591 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GscQ02591 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GscQ02591 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GscQ02591 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GscQ02591 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GscQ02591 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GscQ02591 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GscQ02591 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GscQ02591 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GscQ02591 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GscQ02591 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GscQ02591 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GscQ02591 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GscQ02591 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GscQ02591 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GscQ02591 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GscQ02591 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GscQ02591 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GscQ02591 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GscQ02591 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GscQ02591 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GscQ02591 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GscQ02591 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GscQ02591 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GscQ02591 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GscQ02591 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GscQ02591 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GscQ02591 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GscQ02591 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GscQ02591 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GscQ02591 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GscQ02591 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GscQ02591 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GscQ02591 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GscQ02591 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GscQ02591 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GscQ02591 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GscQ02591 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GscQ02591 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GscQ02591 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GscQ02591 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GscQ02591 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GscQ02591 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GscQ02591 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GscQ02591 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GscQ02591 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GscQ02591 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GscQ02591 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GscQ02591 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GscQ02591 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GscQ02591 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GscQ02591 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GscQ02591 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GscQ02591 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GscQ02591 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GscQ02591 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GscQ02591 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GscQ02591 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GscQ02591 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GscQ02591 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GscQ02591 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GscQ02591 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GscQ02591 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GscQ02591 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GscQ02591 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GscQ02591 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GscQ02591 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GscQ02591 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GscQ02591 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GscQ02591 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GscQ02591 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GscQ02591 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GscQ02591 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms