Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd1Q01822 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd1Q01822 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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