Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nme2Q01768 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme2Q01768 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme2Q01768 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme2Q01768 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme2Q01768 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nme2Q01768 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Nme2Q01768 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme2Q01768 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme2Q01768 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme2Q01768 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme2Q01768 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nme2Q01768 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nme2Q01768 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nme2Q01768 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme2Q01768 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme2Q01768 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme2Q01768 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nme2Q01768 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme2Q01768 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nme2Q01768 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nme2Q01768 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme2Q01768 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme2Q01768 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme2Q01768 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme2Q01768 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme2Q01768 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme2Q01768 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nme2Q01768 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme2Q01768 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme2Q01768 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme2Q01768 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme2Q01768 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme2Q01768 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nme2Q01768 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Nme2Q01768 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nme2Q01768 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nme2Q01768 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nme2Q01768 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme2Q01768 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme2Q01768 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme2Q01768 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme2Q01768 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme2Q01768 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme2Q01768 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme2Q01768 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nme2Q01768 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nme2Q01768 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme2Q01768 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme2Q01768 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nme2Q01768 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme2Q01768 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nme2Q01768 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nme2Q01768 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nme2Q01768 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nme2Q01768 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nme2Q01768 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nme2Q01768 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nme2Q01768 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nme2Q01768 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nme2Q01768 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nme2Q01768 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nme2Q01768 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nme2Q01768 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nme2Q01768 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nme2Q01768 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nme2Q01768 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nme2Q01768 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Nme2Q01768 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Nme2Q01768 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nme2Q01768 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Nme2Q01768 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nme2Q01768 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Nme2Q01768 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nme2Q01768 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Nme2Q01768 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nme2Q01768 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms