Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
EgfrQ01279 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
EgfrQ01279 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms