Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
PrcdQ00LT2 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms