Protein–RNA interactions for Protein: Q00915

Rbp1, Retinol-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp1Q00915 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rbp1Q00915 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rbp1Q00915 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms