Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Rbp4Q00724 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rbp4Q00724 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rbp4Q00724 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Rbp4Q00724 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp4Q00724 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp4Q00724 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp4Q00724 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp4Q00724 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp4Q00724 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp4Q00724 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp4Q00724 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp4Q00724 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp4Q00724 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp4Q00724 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp4Q00724 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp4Q00724 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp4Q00724 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp4Q00724 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp4Q00724 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp4Q00724 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp4Q00724 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp4Q00724 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp4Q00724 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp4Q00724 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp4Q00724 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp4Q00724 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp4Q00724 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp4Q00724 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp4Q00724 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rbp4Q00724 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbp4Q00724 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbp4Q00724 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbp4Q00724 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbp4Q00724 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbp4Q00724 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbp4Q00724 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rbp4Q00724 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms