Protein–RNA interactions for Protein: P97812

Ihh, Indian hedgehog protein, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IhhP97812 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IhhP97812 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IhhP97812 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IhhP97812 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IhhP97812 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IhhP97812 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IhhP97812 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IhhP97812 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IhhP97812 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IhhP97812 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IhhP97812 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IhhP97812 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IhhP97812 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IhhP97812 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IhhP97812 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IhhP97812 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IhhP97812 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IhhP97812 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IhhP97812 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IhhP97812 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IhhP97812 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IhhP97812 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IhhP97812 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IhhP97812 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IhhP97812 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IhhP97812 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IhhP97812 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IhhP97812 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IhhP97812 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IhhP97812 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IhhP97812 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IhhP97812 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IhhP97812 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IhhP97812 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IhhP97812 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IhhP97812 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IhhP97812 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IhhP97812 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IhhP97812 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IhhP97812 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IhhP97812 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IhhP97812 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IhhP97812 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IhhP97812 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IhhP97812 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IhhP97812 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IhhP97812 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IhhP97812 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IhhP97812 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IhhP97812 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IhhP97812 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IhhP97812 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IhhP97812 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IhhP97812 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IhhP97812 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IhhP97812 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IhhP97812 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IhhP97812 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IhhP97812 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IhhP97812 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IhhP97812 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IhhP97812 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IhhP97812 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
IhhP97812 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IhhP97812 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IhhP97812 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
IhhP97812 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IhhP97812 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IhhP97812 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IhhP97812 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IhhP97812 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IhhP97812 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IhhP97812 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IhhP97812 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IhhP97812 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IhhP97812 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IhhP97812 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IhhP97812 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IhhP97812 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IhhP97812 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IhhP97812 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IhhP97812 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IhhP97812 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IhhP97812 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IhhP97812 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IhhP97812 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IhhP97812 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IhhP97812 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IhhP97812 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IhhP97812 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IhhP97812 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IhhP97812 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IhhP97812 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IhhP97812 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IhhP97812 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IhhP97812 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IhhP97812 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
IhhP97812 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
IhhP97812 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
IhhP97812 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms