Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Smn1P97801 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Smn1P97801 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smn1P97801 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smn1P97801 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Smn1P97801 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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