Protein–RNA interactions for Protein: P97784

Cry1, Cryptochrome-1, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry1P97784 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cry1P97784 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cry1P97784 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cry1P97784 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cry1P97784 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cry1P97784 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cry1P97784 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cry1P97784 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cry1P97784 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cry1P97784 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cry1P97784 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cry1P97784 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms