Protein–RNA interactions for Protein: P81069

Gabpb2, GA-binding protein subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabpb2P81069 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gabpb2P81069 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gabpb2P81069 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms