Protein–RNA interactions for Protein: P70414

Slc8a1, Sodium/calcium exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a1P70414 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc8a1P70414 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Slc8a1P70414 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8a1P70414 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8a1P70414 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8a1P70414 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8a1P70414 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8a1P70414 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8a1P70414 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8a1P70414 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8a1P70414 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8a1P70414 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8a1P70414 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8a1P70414 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8a1P70414 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8a1P70414 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8a1P70414 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8a1P70414 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8a1P70414 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8a1P70414 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8a1P70414 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8a1P70414 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8a1P70414 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8a1P70414 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8a1P70414 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8a1P70414 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8a1P70414 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8a1P70414 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8a1P70414 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8a1P70414 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8a1P70414 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8a1P70414 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8a1P70414 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8a1P70414 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Slc8a1P70414 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc8a1P70414 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms