Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rad50P70388 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rad50P70388 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rad50P70388 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rad50P70388 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rad50P70388 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Rad50P70388 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Rad50P70388 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad50P70388 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad50P70388 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad50P70388 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad50P70388 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rad50P70388 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms