Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeboxP70368 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeboxP70368 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SeboxP70368 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeboxP70368 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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SeboxP70368 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeboxP70368 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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SeboxP70368 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeboxP70368 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeboxP70368 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeboxP70368 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
SeboxP70368 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms