Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msx3P70354 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msx3P70354 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx3P70354 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx3P70354 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx3P70354 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx3P70354 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Msx3P70354 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms