Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Vamp7P70280 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vamp7P70280 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms