Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3P62908 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3P62908 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3P62908 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3P62908 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3P62908 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps3P62908 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps3P62908 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps3P62908 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rps3P62908 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms