Protein–RNA interactions for Protein: P62320

Snrpd3, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd3P62320 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Snrpd3P62320 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms