Protein–RNA interactions for Protein: P61961

Ufm1, Ubiquitin-fold modifier 1, mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufm1P61961 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufm1P61961 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufm1P61961 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ufm1P61961 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ufm1P61961 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ufm1P61961 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ufm1P61961 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ufm1P61961 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ufm1P61961 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ufm1P61961 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ufm1P61961 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufm1P61961 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufm1P61961 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufm1P61961 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufm1P61961 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufm1P61961 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufm1P61961 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ufm1P61961 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufm1P61961 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ufm1P61961 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ufm1P61961 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ufm1P61961 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ufm1P61961 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufm1P61961 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufm1P61961 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufm1P61961 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufm1P61961 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ufm1P61961 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufm1P61961 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufm1P61961 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufm1P61961 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ufm1P61961 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ufm1P61961 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufm1P61961 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufm1P61961 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ufm1P61961 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufm1P61961 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufm1P61961 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufm1P61961 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufm1P61961 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufm1P61961 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufm1P61961 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufm1P61961 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufm1P61961 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufm1P61961 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufm1P61961 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ufm1P61961 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufm1P61961 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufm1P61961 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufm1P61961 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufm1P61961 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ufm1P61961 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufm1P61961 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufm1P61961 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ufm1P61961 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ufm1P61961 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ufm1P61961 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufm1P61961 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ufm1P61961 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufm1P61961 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ufm1P61961 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ufm1P61961 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ufm1P61961 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufm1P61961 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufm1P61961 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufm1P61961 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufm1P61961 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufm1P61961 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufm1P61961 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ufm1P61961 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ufm1P61961 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ufm1P61961 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ufm1P61961 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ufm1P61961 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ufm1P61961 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ufm1P61961 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ufm1P61961 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ufm1P61961 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ufm1P61961 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ufm1P61961 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ufm1P61961 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ufm1P61961 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ufm1P61961 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ufm1P61961 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms