Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smg6P61406 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smg6P61406 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg6P61406 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg6P61406 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg6P61406 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Smg6P61406 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg6P61406 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg6P61406 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Smg6P61406 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms