Protein–RNA interactions for Protein: P61264

Stx1b, Syntaxin-1B, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1bP61264 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Stx1bP61264 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx1bP61264 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx1bP61264 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx1bP61264 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx1bP61264 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx1bP61264 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx1bP61264 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx1bP61264 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx1bP61264 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx1bP61264 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx1bP61264 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx1bP61264 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx1bP61264 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx1bP61264 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx1bP61264 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx1bP61264 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx1bP61264 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx1bP61264 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx1bP61264 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx1bP61264 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx1bP61264 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx1bP61264 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Stx1bP61264 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms