Protein–RNA interactions for Protein: P61222

Abce1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abce1P61222 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abce1P61222 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Abce1P61222 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Abce1P61222 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abce1P61222 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abce1P61222 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abce1P61222 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abce1P61222 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abce1P61222 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abce1P61222 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abce1P61222 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Abce1P61222 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms