Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CgnP59242 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CgnP59242 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CgnP59242 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CgnP59242 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CgnP59242 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CgnP59242 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CgnP59242 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CgnP59242 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CgnP59242 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CgnP59242 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CgnP59242 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CgnP59242 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CgnP59242 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CgnP59242 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CgnP59242 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CgnP59242 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CgnP59242 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CgnP59242 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CgnP59242 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CgnP59242 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CgnP59242 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CgnP59242 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CgnP59242 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CgnP59242 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CgnP59242 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CgnP59242 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CgnP59242 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CgnP59242 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CgnP59242 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CgnP59242 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CgnP59242 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CgnP59242 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CgnP59242 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CgnP59242 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CgnP59242 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CgnP59242 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CgnP59242 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CgnP59242 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CgnP59242 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CgnP59242 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CgnP59242 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CgnP59242 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CgnP59242 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CgnP59242 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CgnP59242 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CgnP59242 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CgnP59242 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CgnP59242 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CgnP59242 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CgnP59242 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CgnP59242 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CgnP59242 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CgnP59242 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CgnP59242 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CgnP59242 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CgnP59242 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CgnP59242 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CgnP59242 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CgnP59242 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CgnP59242 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CgnP59242 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CgnP59242 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CgnP59242 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CgnP59242 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CgnP59242 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CgnP59242 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CgnP59242 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CgnP59242 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CgnP59242 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CgnP59242 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CgnP59242 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CgnP59242 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CgnP59242 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CgnP59242 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CgnP59242 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CgnP59242 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CgnP59242 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CgnP59242 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CgnP59242 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CgnP59242 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CgnP59242 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CgnP59242 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CgnP59242 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CgnP59242 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CgnP59242 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CgnP59242 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CgnP59242 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CgnP59242 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CgnP59242 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CgnP59242 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CgnP59242 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CgnP59242 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CgnP59242 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CgnP59242 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CgnP59242 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CgnP59242 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CgnP59242 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CgnP59242 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CgnP59242 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
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