Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd4P58467 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd4P58467 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd4P58467 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd4P58467 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd4P58467 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd4P58467 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Setd4P58467 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Setd4P58467 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Setd4P58467 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Setd4P58467 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Setd4P58467 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Setd4P58467 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Setd4P58467 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Setd4P58467 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Setd4P58467 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Setd4P58467 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Setd4P58467 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Setd4P58467 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Setd4P58467 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Setd4P58467 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Setd4P58467 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Setd4P58467 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Setd4P58467 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Setd4P58467 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Setd4P58467 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Setd4P58467 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Setd4P58467 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Setd4P58467 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms