Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Dpf3P58269 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms