Protein–RNA interactions for Protein: P56450

Mc4r, Melanocortin receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc4rP56450 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mc4rP56450 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mc4rP56450 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mc4rP56450 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mc4rP56450 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mc4rP56450 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Mc4rP56450 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.3 ms