Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp5P56399 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp5P56399 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp5P56399 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Usp5P56399 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp5P56399 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp5P56399 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp5P56399 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp5P56399 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp5P56399 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Usp5P56399 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms