Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RabggtbP53612 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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