Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cux1P53564 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cux1P53564 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cux1P53564 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cux1P53564 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cux1P53564 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cux1P53564 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cux1P53564 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cux1P53564 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cux1P53564 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms