Protein–RNA interactions for Protein: P52850

Ndst2, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst2P52850 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndst2P52850 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndst2P52850 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndst2P52850 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndst2P52850 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndst2P52850 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndst2P52850 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndst2P52850 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndst2P52850 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndst2P52850 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndst2P52850 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndst2P52850 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndst2P52850 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndst2P52850 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndst2P52850 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndst2P52850 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndst2P52850 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndst2P52850 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ndst2P52850 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ndst2P52850 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms