Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ClgnP52194 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClgnP52194 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClgnP52194 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClgnP52194 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ClgnP52194 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClgnP52194 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClgnP52194 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClgnP52194 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClgnP52194 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClgnP52194 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClgnP52194 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClgnP52194 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ClgnP52194 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms