Protein–RNA interactions for Protein: P51908

Apobec1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec1P51908 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apobec1P51908 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms