Protein–RNA interactions for Protein: P51642

Cntf, Ciliary neurotrophic factor, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfP51642 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfP51642 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfP51642 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfP51642 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfP51642 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfP51642 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfP51642 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfP51642 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfP51642 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfP51642 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfP51642 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfP51642 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfP51642 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfP51642 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfP51642 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfP51642 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfP51642 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfP51642 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfP51642 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfP51642 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CntfP51642 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfP51642 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfP51642 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfP51642 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfP51642 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfP51642 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfP51642 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfP51642 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfP51642 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfP51642 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfP51642 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfP51642 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfP51642 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfP51642 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfP51642 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfP51642 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfP51642 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfP51642 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfP51642 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfP51642 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfP51642 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfP51642 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfP51642 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfP51642 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfP51642 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfP51642 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfP51642 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfP51642 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfP51642 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfP51642 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfP51642 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfP51642 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfP51642 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfP51642 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CntfP51642 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntfP51642 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntfP51642 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntfP51642 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntfP51642 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntfP51642 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntfP51642 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntfP51642 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntfP51642 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntfP51642 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntfP51642 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntfP51642 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntfP51642 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntfP51642 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntfP51642 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntfP51642 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntfP51642 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntfP51642 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntfP51642 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntfP51642 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntfP51642 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntfP51642 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntfP51642 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CntfP51642 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CntfP51642 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CntfP51642 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CntfP51642 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CntfP51642 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CntfP51642 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
CntfP51642 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntfP51642 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntfP51642 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntfP51642 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntfP51642 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntfP51642 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntfP51642 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntfP51642 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntfP51642 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntfP51642 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntfP51642 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntfP51642 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CntfP51642 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CntfP51642 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CntfP51642 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntfP51642 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CntfP51642 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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