Protein–RNA interactions for Protein: P51410

Rpl9, 60S ribosomal protein L9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl9P51410 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rpl9P51410 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl9P51410 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl9P51410 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rpl9P51410 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms