Protein–RNA interactions for Protein: P50752

Tnnt2, Troponin T, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt2P50752 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tnnt2P50752 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Tnnt2P50752 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms