Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa6P50704 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa6P50704 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa6P50704 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa6P50704 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa6P50704 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa6P50704 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Defa6P50704 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa6P50704 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa6P50704 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Defa6P50704 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms