Protein–RNA interactions for Protein: P50652

Fancc, Fanconi anemia group C protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanccP50652 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FanccP50652 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FanccP50652 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FanccP50652 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
FanccP50652 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
FanccP50652 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FanccP50652 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FanccP50652 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FanccP50652 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FanccP50652 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FanccP50652 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FanccP50652 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FanccP50652 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FanccP50652 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FanccP50652 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FanccP50652 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FanccP50652 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FanccP50652 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FanccP50652 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FanccP50652 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
FanccP50652 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FanccP50652 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FanccP50652 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FanccP50652 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FanccP50652 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FanccP50652 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FanccP50652 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FanccP50652 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FanccP50652 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FanccP50652 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FanccP50652 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FanccP50652 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FanccP50652 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FanccP50652 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FanccP50652 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FanccP50652 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FanccP50652 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FanccP50652 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FanccP50652 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FanccP50652 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FanccP50652 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
FanccP50652 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FanccP50652 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
FanccP50652 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FanccP50652 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FanccP50652 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FanccP50652 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FanccP50652 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FanccP50652 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FanccP50652 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FanccP50652 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FanccP50652 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FanccP50652 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FanccP50652 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FanccP50652 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
FanccP50652 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FanccP50652 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FanccP50652 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FanccP50652 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FanccP50652 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FanccP50652 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FanccP50652 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FanccP50652 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FanccP50652 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FanccP50652 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FanccP50652 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FanccP50652 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FanccP50652 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FanccP50652 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FanccP50652 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FanccP50652 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
FanccP50652 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FanccP50652 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FanccP50652 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FanccP50652 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FanccP50652 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FanccP50652 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FanccP50652 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
FanccP50652 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FanccP50652 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
FanccP50652 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FanccP50652 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FanccP50652 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FanccP50652 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FanccP50652 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FanccP50652 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FanccP50652 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FanccP50652 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FanccP50652 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FanccP50652 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FanccP50652 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FanccP50652 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FanccP50652 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FanccP50652 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FanccP50652 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
FanccP50652 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FanccP50652 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FanccP50652 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
FanccP50652 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
FanccP50652 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.6 ms