Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
BckdhaP50136 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
BckdhaP50136 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.4 ms