Protein–RNA interactions for Protein: P49429

Hpd, 4-hydroxyphenylpyruvate dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HpdP49429 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HpdP49429 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HpdP49429 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HpdP49429 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HpdP49429 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HpdP49429 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HpdP49429 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HpdP49429 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HpdP49429 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HpdP49429 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HpdP49429 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HpdP49429 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HpdP49429 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HpdP49429 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HpdP49429 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HpdP49429 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HpdP49429 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HpdP49429 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HpdP49429 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HpdP49429 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HpdP49429 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HpdP49429 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HpdP49429 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HpdP49429 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HpdP49429 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HpdP49429 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HpdP49429 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HpdP49429 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HpdP49429 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HpdP49429 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HpdP49429 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HpdP49429 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HpdP49429 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HpdP49429 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HpdP49429 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HpdP49429 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HpdP49429 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HpdP49429 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HpdP49429 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HpdP49429 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HpdP49429 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HpdP49429 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HpdP49429 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HpdP49429 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HpdP49429 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HpdP49429 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HpdP49429 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HpdP49429 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HpdP49429 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HpdP49429 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HpdP49429 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HpdP49429 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HpdP49429 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HpdP49429 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HpdP49429 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HpdP49429 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HpdP49429 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HpdP49429 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HpdP49429 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HpdP49429 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HpdP49429 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HpdP49429 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HpdP49429 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HpdP49429 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HpdP49429 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HpdP49429 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HpdP49429 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HpdP49429 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HpdP49429 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HpdP49429 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HpdP49429 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HpdP49429 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HpdP49429 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HpdP49429 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HpdP49429 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HpdP49429 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HpdP49429 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HpdP49429 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HpdP49429 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HpdP49429 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HpdP49429 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HpdP49429 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HpdP49429 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HpdP49429 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HpdP49429 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HpdP49429 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HpdP49429 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HpdP49429 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HpdP49429 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HpdP49429 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HpdP49429 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HpdP49429 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HpdP49429 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HpdP49429 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HpdP49429 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HpdP49429 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HpdP49429 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HpdP49429 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HpdP49429 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HpdP49429 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms