Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbp3P49194 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbp3P49194 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbp3P49194 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbp3P49194 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbp3P49194 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbp3P49194 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbp3P49194 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbp3P49194 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbp3P49194 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbp3P49194 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbp3P49194 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbp3P49194 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbp3P49194 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbp3P49194 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms